此外，《意见》还强调了加强临床专科建设和对中医医院的支持。临床专科建设要以满足重大疾病的临床需求为导向，重点发展各个专科领域，如重症、肿瘤、心脑血管、呼吸、消化、感染、儿科、麻醉、影像、病理和检验等。同时，要持续改进医疗质量管理体系和标准体系，提高不同地区和不同级别的公立医院的医疗服务水平和同质化水平。
对于重大疫情救治体系的建立，意见提出要建立健全的分级分层分流体系。可以利用现有资源，快速推进国家医学中心、区域医疗中心和省级医疗中心以及省级区域医疗中心的设置和建设，以应对传染病、创伤和重大公共卫生事件。此外，还要支持部分实力强的公立医院适度建设多院区，以便在发生重大疫情时能够快速转换功能。每个地市还可以选择一家综合医院，重点提升其传染病救治能力，并进行基础设施改善和设备升级。
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