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你如何看上海科技大学iHuman研究所博士生华甜每

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网友回答

  

这其实是一个有些沉重的问题。

做过一点结构生物学,所以……我先带小伙伴们看一下长蛋白晶体的实验室吧,相信大家看过之后会有自己的想法的(虽然在化学院做结构生物学听起来有一点山寨,不过大部分东西都是一样的嗯)。

长晶体归根结底是要让蛋白溶液达到合适的过饱和度,成核,然后在合适的条件下以合适的速度长大,长成一颗晶莹剔透的单晶,像这样:

上图是我之前拿到的一个蛋白和DNA复合物的晶体。然而,对于某个蛋白怎样的生长条件才是“合适”的,却几乎没有任何办法可以预测,甚至在蛋白中加入一个小分子,或者改变一个氨基酸残基,晶体生长的条件就会截然不同(因为蛋白的构象已经改变了)。

对于这样一门玄学,人们唯一可以做的事情就是……筛选大量不同的条件。从方法学上来讲,这叫穷举法,用码农的话讲,这叫字典攻击,而通俗的讲,就叫瞎猫去摸死耗子。

Hampton爸爸就搞出了很多很多这样的条件(就是不同的供晶体生长的缓冲液),精心包在盒子里,卖给准备穷举晶体生长条件的课题组,上面是其中一个。

这种盒子可以堆满一面墙,下图是其中一部分:

而条件的筛选是在这样的板子上进行的,有这种48条件×2个重复的

还有这种96条件×3重复的

当然还有其它的规格,就不一一例举了。

而砖工们要做的事情,就是吸取一些这样的缓冲液:

加到缓冲液池中:

然后把蛋白溶液加到旁边的小洞里:

最后取等量的池液和蛋白溶液混合。

一块板子,就是这样重复48次或者96次。然后,

每天十几个小时,这样的板子堆满一个个架子:

这样……

没有地方了就堆到角落去:

空间有限,最多两个月没有晶体长出来或者长得不好的板子就会被扔掉,所以这里看到的只是绝少的一部分了。

还有这许多自己配制的筛选条件,通常是针对Hampton爸爸的某个条件做的优化——说是优化,其实也是在一个小一些的范围的继续……穷举。

其实小伙伴们肯定都可以看出来,这些板子形状规则,操作简单重复,完全可以交给自动加样系统来做。

↑↑来看神器mosquito LCP,各种hanging drop、sitting drop、加additive都没问题哦。

而在国内,这些机械的工作都是由华甜这样的正在最好年华的研究生来完成。显然,正如 @喷喷更健康 所说,国内这些老实的硕博比机器人还好用啊,还便宜哟。

更有甚者,某些颇有声名的结构生物学实验室,把晶体生长以及前期的蛋白表达、纯化等过程分成若干个模块,交给不同的学生分别完成,整个研究生阶段,可能每个人一直都在做同一件事情。

我看不出这样的博士和流水线上的张全蛋们有什么区别。

她在人群中是不起眼的。160厘米的身高,体重只有42公斤,看上去弱不禁风。
她不善言辞。“只要在公开场合讲话,我就会紧张。”
她对自己的评价是“不食人间烟火”。连续四年几乎每天在实验室工作17小时,除了整天打交道的蛋白结构,她对科研以外的事情几乎没有什么了解。

那回到题目上,我想,我实在不能认同,让一个女孩子最好的年华耗费在这些纯机械的操作之中,狭小阴暗的恒温房间里,柔弱的身躯紧缩的眉头,移液器的一举一放都让人心疼,更何况还是几万次甚至十几万次。

这只是对“砖工”这个词最好的注脚。

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