香农指数和辛普森指数均呈下降趋势

时间：2022-02-26 14:16:30

为了评估真菌群落的变化，在从SB到1B3L的枝条发育过程中分析了真菌物种丰富度。根据观察物种和Chao1指数没有明显变化，香农指数和辛普森指数均呈下降趋势。真菌群落多样性较低的主要原因是芽发育后期的均匀度降低。微生物群落的时间模式组装的特点是细菌和真菌群落的不同趋势，这表明特定发育阶段的适应可能是高度特异性的。

我们又进一步计算了每个样方中的多样性指数。综合来看，不论是着重衡量优势度的辛普森指数还是进一步包含了均匀度的香农-威纳指数，郁闭度和的样方在疏伐后均有提升（虽然这个提升并没有统计学上的显著性），而实际上没有进行疏伐的和的样方却在多样性指数上略有下降。

病毒广泛分布在各种生态系统中，对于环境中微生物进化、结构和功能具有重要影响。油藏是储藏石油的地下深层环境，在极端的条件下仍然存在大量的微生物，并且基于油藏微生物的功能研发出微生物驱油技术，但关于此过程中病毒群落情况知之甚少。在本研究中在大庆油田长期使用水驱油和微生物驱油技术的两个区域收集注入水和采出水样本，利用荧光显微镜对样本中的病毒颗粒（VLP）和细菌进行计数，并且进行宏病毒组测序分析其中的病毒组成和多样性情况。通过计数发现油藏环境中有大量的病毒存在，远高于细菌的数量，而宏病毒组分析结果表明有大量位置病毒存在，并且水驱油样本的病毒香农指数高于微生物驱油样本。

对于每个样本均选取相对丰度高于1%的病毒定义为优势病毒用于后续的研究分析，根据符合筛选条件的病毒相对丰度绘制热图发现，水驱油的的注入水和采出水样本的优势病毒的相对丰度情况有所差异，而在微生物驱油样本的优势病毒相对丰度情况与水驱油样本的整体相似。通过病毒-宿主数据库对优势病毒进行宿主预测，发现45.16%的优势病毒能找到对应的宿主。基于Bray-Curtis矩阵的PCoA分析表明，与水驱油采出水样品相比，微生物驱油的采出水样品间的病毒群落差异较小（图3.B），说明微生物驱油的营养激活剂注入降低了病毒群落结构多样性，而病毒多样性分析发现水驱样品病毒群落的香农指数高于微生物驱样品（图3.A）。

如前所述，α阶决定了指数对稀有或普通物种的敏感性。低于1的orders反映了一种多样性度量，但是这种度量受到稀有种数量的高度影响，而增加αorders对丰富种的敏感性更高，当α=1时，每个物种以其比例丰度加权。因此，香农多样性指数在添加低频无性系时比基尼-辛普森指数有较高的变异。

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